Glavni igrač u katalitičkom mehanizmu u serinskim proteazama je katalitička trijada katalitička trijada Katalitička trijada je skup od tri koordinirane aminokiseline koje se mogu naći u aktivnim mjesto nekih enzima. Katalitičke trijade najčešće se nalaze u enzimima hidrolaze i transferaze (npr. proteaze, amidaze, esteraze, acilaze, lipaze i β-laktamaze). https://en.wikipedia.org › wiki › Catalytic_triad
Katalitička trijada - Wikipedia
. … Serin ima -OH skupinu koja može djelovati kao nukleofil, napadajući karbonilni ugljik cisilne peptidne veze supstrata.
Kako djeluju inhibitori serinske proteaze?
Inhibitori serinskih proteaza, ili serpini, čine obitelj proteina koji intagoniziraju aktivnost serinskih proteaza. … U ovom mehanizmu, serpin predstavlja peptidni slijed koji oponaša supstrat – petlju reaktivnog centra – svojoj ciljnoj serinskoj proteazi.
Koju ulogu u mehanizmu reakcije serinske proteaze ima sustav releja punjenja?
Uloga Asp102 u katalitičkom relejnom sustavu serinskih proteaza se teoretski proučava izračunavanjem profila slobodne energije jedne reakcije prijenosa protona od strane mutantnog tripsina Asn102 i usklađena reakcija dvostrukog prijenosa protona (tzv. mehanizam releja punjenja) divljeg tipa tripsina.
Što je od sljedećeg primjer serinske proteaze?
Chymotrypsin: > Koristi se kao primjer serinske proteaze jer su njezina struktura i mehanizam dobro shvaćeni.
Koji su razlozi naziva serinskih proteaza?
Zovu se serinske proteaze iz dva razloga:
- Oni hidroliziraju proteine.
- Imaju esencijalni Ser ostatak na aktivnom mjestu koji je kritičan za katalizu. Zapravo, ovaj Ser je puno reaktivniji od ostalih serina u proteinu.