Budući da DdNTP-i imaju molekulu vodika (-H) umjesto hidroksilne skupine (-OH) koja je vezana za 3'-C svoje deoksiriboze, ne može se vezati ni na jedan dolazni nukleotid. Stoga se dodavanje DdNTP-a tijekom replikacije DNK može koristiti za prekid reakcije sinteze.
Zašto se sinteza DNK zaustavlja kada se ddNTP ugradi u rastući lanac DNK?
Ako je dodani nukleotid "dideoksinukleotid" (slika 6.29), 3' kraj rastućeg niza sada će imati H, a ne OH. To će spriječiti dodavanje bilo kakvih dodatnih nukleotida; tj. in vitro sinteza DNK će se zaustaviti u ovom trenutku.
Kako ddNTP prekida sintezu DNK?
Kada se ddNTP ugradi u lanac nukleotida, sinteza se prekida. To je zato što molekuli ddNTP nedostaje 3' hidroksilna skupina, koja je potrebna za formiranje veze sa sljedećim nukleotidom u lancu.
Zašto DdNTP-ovi prekidaju proces replikacije?
Laboratorijske metode u enzimologiji: DNK
Dideoksinukleotid trifosfati se lako ugrađuju u rastući lanac DNK, ali nemaju 3′ hidroksilnu skupinu potrebnu za nastavak lancai učinkovito prekinuti polimerizaciju.
Zašto dideoksinukleotidi uzrokuju zaustavljanje replikacije DNK?
Ovim ddNTP-ovima nedostaje 3′-OH skupina koja je potrebna za stvaranje fosfodiesterske veze između dvanukleotidi, što uzrokuje zaustavljanje produžetka lanca DNA kada se doda ddNTP.
