U molekularnoj biologiji, STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) je biološka baza podataka i web-resurs poznatih i predviđenih interakcija protein-protein. … Najnovija verzija 11b sadrži informacije o oko 24,5 milijuna proteina iz više od 5000 organizama.
Koja je svrha baze podataka STRING?
Baza podataka STRING ima za cilj prikupiti i integrirati ove informacije, konsolidacijom poznatih i predviđenih proteina–podataka o povezanosti proteina za veliki broj organizama.
Što je rezultat STRING?
U STRING, svaka interakcija protein-protein označena je jednim ili više 'bodova'. Važno je da ti rezultati ne ukazuju na snagu ili specifičnost interakcije. Umjesto toga, oni su indikatori povjerenja, tj. kolika je vjerojatnost da STRING ocijeni da je interakcija istinita, s obzirom na dostupne dokaze.
Zašto proteini međusobno djeluju?
Interakcije protein-protein (PPI) su fizički kontakti visoke specifičnosti uspostavljeni između dvije ili više proteinskih molekula kao rezultat biokemijskih događaja kojima upravljaju interakcije koje uključuju elektrostatičke sile, vodik vezivanje i hidrofobni učinak.
Što je funkcionalna povezanost?
definicija. Binarni odnos između bioloških entiteta kada jedan od njih modulira drugi u smislu funkcije, ekspresije, degradacije ili stabilnosti drugog i odnosaizmeđu partnera ne može se utvrditi kao izravna, pa su međukoraci implicitno prisutni.
