Nasuprot tome, većina eukariotskih DNA ligaza, zajedno s arhealnim i bakteriofagnim enzimima, spadaju u drugu pod-porodicu; ovi enzimi koriste ATP kao kofaktor.
Da li ligaze zahtijevaju ATP?
Uobičajeno se koriste dvije DNK ligaze. … T4 ligaza zahtijeva ATP dok E. coli ligaza zahtijeva NAD+ (nikotinamid adenin dinukleotid je koenzim koji se sastoji od 2 nt spojena preko svojih fosfatnih grupa). Oba kataliziraju spajanje 5′-fosfatne i 3′-OH grupe kako bi se formirala fosfodiesterska veza.
Zašto je ligazama potreban ATP?
Dva koraka reakcije ligacije DNA
Sama reakcija ligacije DNA ima dva osnovna koraka. Prvo krajevi DNK moraju se slučajno sudariti i ostati zajedno dovoljno dugo da im se ligaza pridruži. … Da bi enzim mogao provesti daljnje reakcije, AMP u aktivnom mjestu enzima mora se nadopuniti ATP-om.
Koje su funkcije ligaza?
DNA ligaze igraju bitnu ulogu u održavanju genomskog integriteta spajanjem lomova u fosfodiesterskoj okosnici DNK koji nastaju tijekom replikacije i rekombinacije, a kao posljedica oštećenja DNK i njezinih popravak. Tri ljudska gena, LIG1, LIG3 i LIG4 kodiraju ATP-ovisne DNA ligaze.
Što su ligaze rade li aktivno ili pasivno?
DNA ligaza je aktivna tijekom replikacije, procesa popravka i rekombinacije DNK. Široko se primjenjuje u popravku jednolančanihlomovi u dupleks DNK živih organizama koristeći komplementarni lanac dvostruke spirale kao predložak, dok neki oblici mogu posebno popraviti dvolančana oštećenja.
