Budući da sonifikacija može potencijalno razgraditi proteine i denaturirati proteinski epitopi, zatim smo procijenili utjecaj ultrazvuka na integritet proteina.
Može li ultrazvuk oštetiti proteine?
Popularni odgovori (1)
Standardni protokol ultrazvuka radije ne može uzrokovati fragmentaciju proteina- energija je preniska. Ne bi smjelo čak ni uzrokovati njegovu denaturaciju. Može se denaturirati kada ga predugo obrađujete ultrazvukom i pregrijete uzorak. Ako koristite kromatografiju nikla, druge trake mogu biti jednostavno nečistoće.
Može li ultrazvuk razbiti peptidne veze?
Obrada ultrazvukom normalno ne može razbiti primarnu strukturuproteina jer je ta struktura (slijed aminokiselina) izgrađena od kovalentnih veza koje su mnogo puta jače od vodikovih veza, a ultrazvuk može osigurati energiju potrebnu za raskid tih veza.
Razbija li sonikacija nuklearnu membranu?
A kratka ultrazvuk s niskom energijom može poremetiti plazma membranu bez razbijanja previše mitohondrijalnih ili nuklearnih membrana koje popuštaju u taktnim mitohondrijima.
Je li sonikacija potrebna za ekstrakciju proteina?
Solubilizacija deterdženta (npr. SDS) koja je potrebna za izolaciju membranskih proteina rezultira lizatom poput ljepila prvenstveno zbog nukleinskih kiselina. Stoga je u takvim slučajevima potrebna obrada ultrazvukom kako bi se poremetile te nukleinske kiseline. Sonikacija generira mnogo topline i nije dobra zamnogo proteina.
