Arabinoza je šećer s pet ugljika koji je široko rasprostranjen u prirodi i može poslužiti kao jedini izvor ugljika u mnogim bakterijama. Proteinski proizvodi iz tri gena (araB, araA i araD) potrebni su za razgradnju arabinoze kod članova obitelji Enterobacteriaceae, kao što su E. coli i S.
Što arabinoza čini bakterijama?
Tako kada je prisutna arabinoza za uključivanje arabinoznog operona, GFP se proizvodi i bakterije mogu fluorescirati. Bez arabinoze, gen GFP nije izražen i nema fluorescencije. Dakle, variranjem sastava hranjivih tvari, istraživač može kontrolirati kada (i ako) dolazi do cvjetanja u transformiranim bakterijama.
Koja je uloga arabinoze u bakterijskoj transformaciji?
Arabinoza djeluje kao alosterički regulator AraC-a, mijenjajući na koja se mjesta DNK veže i kako tvori dimer. Zapamtite da je arabinoza šećer koji se katabolizira od strane proteina AraBAD operona. Kada se arabinoza doda okolini u kojoj živi E. coli, ona se čvrsto veže za AraC.
Zašto se koristi arabinoza?
Upotreba u biologiji
U sintetičkoj biologiji, arabinoza se često koristi kao jednosmjerni ili reverzibilni prekidač za ekspresiju proteina pod Plošepromotor u E. coli. Ovaj se prekidač može poništiti prisutnošću glukoze ili ga poništiti dodavanjem glukoze u mediju kulture što je oblik potiskivanja katabolita.
Kakoutječe li arabinoza na regulaciju gena i ekspresiju u bakterijama?
Kada je prisutna arabinoza, araC opušta konfiguraciju DNK tako da može doći do transkripcije, ali kada je ovaj ugljikohidrat odsutan, isti protein ograničava DNK kako bi smanjio njezinu sposobnost vezanja s RNA polimerazom.
