Uhvatom konformacije kromosoma?

Uhvatom konformacije kromosoma?
Uhvatom konformacije kromosoma?
Anonim

Metode temeljene na hvatanju konformacije kromosoma (3C) otkrivaju organizaciju kromosoma unutar jezgre određivanjem fizičke blizine parova točaka duž kromatina. Oni čuvaju interakcije kromatina umrežavanjem nakon čega slijedi fragmentacija, ligacija i sekvenciranje međudjelujućih regija.

Kako funkcionira hvatanje konformacije kromosoma?

Chromosome conformation capture-on-chip (4C) hvata interakcije između jednog lokusa i svih ostalih genomskih lokusa. Uključuje drugi korak ligacije, kako bi se stvorili samo-cirkularizirani fragmenti DNA, koji se koriste za izvođenje inverznog PCR-a. … Na jednoj mikročipi može se analizirati otprilike milijun interakcija.

Što je hvatanje konformacije kromatina?

Chromatin Conformation Capture (3C) je važna tehnika koja se koristi za proučavanje strukture kromatina, kao i osnova za nekoliko drugih izvedenih tehnika. … Protokol uključuje formaldehidno umrežavanje stanica nakon čega slijedi izolacija kromatina i probava s restrikcijskim enzimom.

Kako Hi-C sekvenciranje funkcionira?

Hi-C pristup proširuje 3C-Seq na mapiranje kromatinskih kontakata u cijelom genomu, a također je primijenjen na proučavanje interakcija kromatina in situ. U ovoj metodi, kompleksi DNA-protein su umreženi formaldehidom. Uzorak je fragmentiran, a DNA je ekstrahirana, vezana i digestirana restrikcijskim enzimima.

Što je Hi-C tehnika?

Klasična Hi-C tehnika uključuje restrikcionu probavu formaldehidnog umreženog genoma s restrikcijskim enzimima specifičnim za sekvencu, nakon čega slijedi popunjavanje i popravak probavljenih krajeva uz ugradnju nukleotidi vezani za biotin. Popravljeni krajevi se zatim ponovno povezuju.

Preporučeni: