Agarozni gelovi se koriste s DNK, zbog veće veličine biomolekula (fragmenti DNK često su tisuće kDa). Za proteinske gelove, poliakrilamid daje dobra rezolucija, jer je daleko manja veličina (tipično 50 kDa) prikladnija za uže međumolekularne praznine gela.
Koja je razlika između elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu?
Glavna razlika između agaroze i poliakrilamida je u tome što se agaroza koristi u elektroforezi agaroznog gela (AGE) uglavnom za odvajanje DNK, dok se poliakrilamid koristi u poliakrilamidnom gelu elektroforeza (PAGE) uglavnom za odvajanje proteina.
Zašto su poliakrilamidni gelovi bolji od agaroznog gela?
Poliakrilamidni gelovi imaju sljedeće tri glavne prednosti u odnosu na agarozne gelove: (1) Njihova moć razlučivanja je tolika da mogu odvojiti molekule DNK čije se duljine razlikuju za samo 0,1% (tj. 1 bp u 1000 bp). (2) Mogu prihvatiti mnogo veće količine DNK od agaroznih gelova.
Zašto se poliakrilamid koristi umjesto agaroze pri karakterizaciji proteina?
Poliakrilamid i agaroza su dvije potporne matrice koje se obično koriste u elektroforezi. … Agaroza ima veliku veličinu pora i prikladna je za odvajanje nukleinskih kiselina i velikih proteinskih kompleksa. Poliakrilamid ima manju veličinu pora i idealan je zaodvajajući većinu proteina i manjih nukleinskih kiselina.
Zašto se koristi poliakrilamidni gel?
Elektroforeza u poliakrilamidnom gelu (PAGE) rutinski se koristi za analizu proteina, a također se može koristiti za odvajanje fragmenata nukleinske kiseline manjih od 100 bp. Nukleinske kiseline se obično analiziraju korištenjem kontinuiranog puferskog sustava gdje postoji konstantan sastav pufera, pH i veličina pora u cijelom gelu.
