BLAST se može koristiti u nekoliko namjena. To uključuje prepoznavanje vrsta, lociranje domena, uspostavljanje filogenije, DNK mapiranje i usporedbu. Uz korištenje BLAST-a, moguće je da možete ispravno identificirati vrstu ili pronaći homologne vrste.
Za što se koristi BLAST?
BLAST je računalni algoritam koji je dostupan za korištenje online na web stranici Nacionalnog centra za biotehnološke informacije (NCBI), kao i na mnogim drugim stranicama. BLAST može brzo uskladiti i usporediti sekvencu DNK upita s bazom podataka sekvenci, što ga čini kritičnim alatom u tekućim genomskim istraživanjima.
Što je BLAST tehnika?
Tehnika BLAST je metoda rješavanja pritužbi koju je razvio Albert Barneto . Mnemonika znači Vjerujte, slušajte, ispričajte se, zadovoljite i zahvalite (tablica 1). 6. Ovaj članak opisuje njegovu korisnost u njezi pacijenata i kao klinički nastavni alat.
Kako BLAST djeluje na DNK?
Kako BLAST radi? BLAST identificira homologne sekvence koristeći heurističku metodu koja u početku pronalazi kratka podudaranja između dvije sekvence; dakle, metoda ne uzima u obzir cijeli prostor sekvence. Nakon početnog podudaranja, BLAST pokušava pokrenuti lokalna poravnanja iz ovih početnih utakmica.
Zašto je BLAST brži od Faste?
U smislu složenosti algoritma izvođenja, BLAST je brži od FASTA pretragom samo značajnijih uzoraka usekvence. Osjetljivost (ili točnost) BLAST-a i FASTA obično je različita za sekvence nukleinskih kiselina i proteina (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).