Prolin se često nalazi na kraju α spirale ili u zavojima ili petljama. Za razliku od drugih aminokiselina koje postoje gotovo isključivo u transformaciji u polipeptidima, prolin može postojati u cis-konfiguraciji u peptidima.
Sadrže li alfa spirale ostatke prolina?
Sada kada postoji više od 30 000 proteinskih struktura u Protein Data Bank, jasno je da su prolinski ostaci prisutni u α-heliksima, gdje često igraju važnu ulogu u strukturi i funkciji proteina.
Koje su aminokiseline u alfa spiralama?
Bilo koja od 20 aminokiselina može sudjelovati u α-heliksu, ali neke su preferiranije od drugih. Ala, Glu, Leu i Met najčešće se nalaze u spiralama dok je manje vjerojatno da će se Gly, Tyr, Ser i Pro vidjeti.
Sadrže li beta listovi prolin?
Proline nije omiljen u beta strukturama listova jer ne može dovršiti mrežu H-vezivanja. Kada se prolin ipak pojavi u listovima, on može biti u izbočini ili rubu ploče gdje nedostatak donera amino vodikove veze nije kritičan.
Što sadrži alfa spirale?
Alfa spirala (α-helix) je čest motiv u sekundarnoj strukturi proteina i predstavlja desnu helix konformaciju u kojoj svaka okosnica N-H grupa vodik veze za okosnicu C=O. skupina aminokiselina smještena četiri ostatka ranije duž proteinske sekvence.
